Исследование Multiomics, раскрывающее характеристики ВИЧ-1-инфицированных клеток in vivo

Для искоренения ВИЧ-1-инфекции важно выяснить подробные особенности и гетерогенность ВИЧ-1-инфицированных клеток in vivo. В этом исследовании гуманизированная мышь с трансплантированными гемопоэтическими стволовыми клетками, инфицированная генно-модифицированным ВИЧ-1, использовалась для выявления множества характеристик клеток, продуцирующих ВИЧ-1, in vivo.

Исследовательская группа из Института медицинских наук Токийского университета (IMSUT), используя ВИЧ-1-инфицированные клетки, провела «мультиомный» анализ – технологии, недавно разработанные для всестороннего исследования свойств биологических образцов.

«Наши результаты описывают множество характеристик клеток, продуцирующих ВИЧ-1 in vivo, которые могут дать ключ к разгадке разработки лекарства от ВИЧ-1», – сказал ведущий ученый Кей Сато, доцент (главный исследователь) в Отделе систем. Вирусология, Отделение инфекционных заболеваний, ИМСУТ. Результаты этого исследования были опубликованы в Cell Reports 14 июля 2020 года.

Исследование для «лечения ВИЧ-1»

Для искоренения ВИЧ-1-инфекции важно получить глубокое понимание разнообразных характеристик ВИЧ-1-инфицированных клеток in vivo.

Недавно разработанный омикс-анализ может стать мощным инструментом для определения характеристик клеток, инфицированных ВИЧ-1. Однако следует отметить, что подавляющее большинство CD4 + Т-клеток у инфицированных людей не инфицированы, и, следовательно, профили транскрипции «массовых» CD4 + Т-клеток in vivo не отражают профили «чистых» продуцирующих ВИЧ-1 клеток. ,

Мультиомный анализ для всестороннего выявления свойств ВИЧ-1-инфицированных клеток in vivo

В этом исследовании исследовательская группа использовала гуманизированную модель мыши с трансплантированными гемопоэтическими стволовыми клетками, которая поддерживает лейкопоэз человека в относительно стабильных иммунологических условиях in vivo, и репортер ВИЧ-1, компетентный к репликации, и использовала четыре недавно разработанных метода для исследования вирусной геномики и транскриптомика.

По мнению исследовательской группы, это исследование состояло из четырех следующих анализов:

Во-первых, капельная цифровая ПЦР выявила наличие потенциальных резервуаров у инфицированных гуманизированных мышей. Во-вторых, опосредованная лигированием ПЦР показала предпочтение ВИЧ-1 интегрироваться в открытые области хроматина, о чем свидетельствует ассоциация эпигенетических модификаций сайтов интеграции с продуцированием вирусов. В-третьих, цифровое секвенирование РНК позволило количественно определить абсолютное число копий вирусных транскриптов в клетках, продуцирующих ВИЧ-1, in vivo и дополнительно идентифицировать гены, экспрессирующиеся по-разному между инфицированными вирусом и неинфицированными клетками. Наконец, секвенирование одноклеточной РНК выявило и охарактеризовало гетерогенность клеток, продуцирующих ВИЧ-1, in vivo.

Доцент Сато подчеркнул: «Насколько нам известно, это исследование является первым исследованием, описывающим множество аспектов клеток, продуцирующих ВИЧ-1, а также первым всесторонним исследованием характеристик ВИЧ-1-инфицированных клеток in vivo».

услуги нутрициологаАвтор сайта и статей: Наталья Степанова, нутрициолог-психолог, консультант по питанию и коррекции веса. Подробнее обо мне

Я в соц. сетях: Vk, Instagram.

Рейтинг
Еще статьи нутрициолога:
Adblock
detector