Новый алгоритм прогнозирования идентифицирует ранее необнаруженные гены-драйверы рака

Новое исследование, проведенное учеными из Калифорнийского университета в Ирвине, углубило понимание эпигенетических механизмов онкогенеза и выявило ранее не обнаруженный репертуар генов-драйверов рака. Исследование было опубликовано на этой неделе в журнале Science Advances .

Используя новый алгоритм прогнозирования, названный DORGE (открытие онкогенов и генов-супрессоров опухолей с использованием генетических и эпигенетических особенностей), исследователи смогли идентифицировать новые гены-супрессоры опухолей (TSG) и онкогены (OG), особенно с редкими мутациями, путем интеграции наиболее полный набор генетических и эпигенетических данных.

«Существующие биоинформатические алгоритмы недостаточно используют эпигенетические особенности для прогнозирования генов-драйверов рака , несмотря на тот факт, что эпигенетические изменения, как известно, связаны с генами-драйверами рака», – сказал старший автор Вэй Ли, доктор философии, председатель Грейс Б. Белл. и профессор биоинформатики факультета биологической химии Медицинской школы UCI. «Наш вычислительный алгоритм объединяет общедоступные данные об эпигенетических и генетических изменениях, чтобы улучшить предсказание генов-драйверов рака».

Рак возникает в результате накопления ключевых генетических изменений, нарушающих баланс между делением клеток и апоптозом. Гены с «драйверными» мутациями, которые влияют на прогрессирование рака, известны как гены-драйверы рака и могут быть классифицированы как TSG и онкогены OG в зависимости от их роли в прогрессировании рака.

Это исследование продемонстрировало, как гены-драйверы рака, предсказанные DORGE, включают как известные гены-драйверы рака, так и новые гены-драйверы, о которых не сообщается в текущей литературе. Кроме того, исследователи обнаружили, что новые двойные функциональные гены , которые, по прогнозам DORGE, являются как TSG, так и OG, сильно обогащены в узлах белок-белкового взаимодействия (PPI) и в сетях лекарство / соединение-ген.

«Наш алгоритм DORGE успешно использовал общедоступные данные для обнаружения генетических и эпигенетических изменений, которые играют важную роль в нарушении регуляции генов-драйверов рака», – пояснил Ли. «Эти результаты могут сыграть важную роль в улучшении профилактики, диагностики и лечения рака в будущем».

услуги нутрициологаАвтор сайта и статей: Наталья Степанова, нутрициолог-психолог, консультант по питанию и коррекции веса. Подробнее обо мне

Я в соц. сетях: Vk, Instagram.

Рейтинг
Еще статьи нутрициолога:
Adblock
detector